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柔然退兵后，边境虽暂时平静，暗流却在朝堂深处翻涌。高湛凯旋当日，京城突然爆发离奇疫病，患者高热不退、口吐黑血，短短三日便蔓延至三分之一的坊市。太医院束手无策，民间谣言西起，首指这是“天罚”，暗讽高湛陆真掌权招致神怒。
陆真在御研坊彻夜不眠，将患者血样滴入自制的纳米检测仪。幽蓝的荧光屏上，病毒状物质正疯狂吞噬血细胞，这场景让她瞳孔骤缩——竟与现代的埃博拉病毒特征高度相似。她立刻联想起出征前娄太后余党送来的西域琉璃盏，琉璃盏夹层残留的粉末，或许正是这场疫病的源头。
与此同时，高湛在朝中遭遇弹劾。御史大夫联名上书，称高湛在前线滥用军饷，私自打造“妖器”（暗指陆真改良的兵器）。更有人在朝堂上公然质疑：“陆女官整日摆弄神秘器物，如今疫病横行，分明是妖术反噬！”高湛将边关缴获的柔然密信掷于龙案，信中赫然写着“借疫乱齐”西字，却仍无法平息众议。
陆真决定兵行险着。她带着玲珑潜入染病最深的贫民窟，用纳米探针提取患者体内病毒，又采集疫区水源、空气样本。在窑炉改造的实验室里，她将从草药中提取的抗菌成分与纳米载体融合，制成可雾化的药剂。当第一支实验针剂注入垂危患者体内时，纳米机器人顺着血管靶向攻击病毒，患者发黑的指甲竟以肉眼可见的速度恢复血色。
然而，就在陆真准备大规模配制解药时，御研坊的高岭土与药材突然断供。她暗中追查，发现是礼部尚书勾结药商，企图逼她就范。陆真冷笑一声，取出一枚夜光瓷瓶——这是用纳米级磷粉烧制的“照明神器”。她将样品献给皇上，称若批量生产，可替代昂贵的鱼油烛火，节省国库开支。皇上大喜，当即下旨由御研坊全权督办，陆真借此夺回物资调配权。
高湛则在军中安插眼线，揪出了散播军饷谣言的将领。审讯时，将领咬舌自尽前，手中紧攥半枚刻着娄氏徽记的玉佩。高湛意识到，娄太后虽被囚，其胞弟娄昭仍在暗中操控一切，而这场疫病，或许正是娄昭与柔然新的合谋。
当陆真的纳米药剂化作白雾笼罩疫区，垂死的百姓奇迹般苏醒时，娄昭终于坐不住了。他买通禁卫军统领，准备在高湛主持的祈福大典上发动政变。却不知，陆真早己在大典所用的香炉中暗藏纳米追踪虫，娄昭的每一个动作，都通过闪烁的青烟投影在她特制的铜镜之上……
击退柔然之后，北齐朝堂上一片欢呼，可高湛和陆真还来不及喘口气，新的麻烦就来了。
朝中的一些保守势力开始发难，他们认为陆真搞科研、改良兵器的行为耗费了太多的钱财和人力，这完全是在浪费资源。有个大臣甚至在朝堂上大声说道：“陛下，老臣觉得陆女官整日鼓捣那些奇奇怪怪的东西，实在是有违祖宗规矩，而且还花费了大量的库银，长此以往，国库空虚，这江山社稷可如何是好啊！”此言一出，附和声一片。
高湛皱了皱眉头，耐心解释道：“诸位爱卿，陆女官的科研成果，在此次对抗柔然的战争中发挥了巨大作用，改良后的兵器让我军在战场上更具优势，这是对国家安危的长远考虑。”但那些保守派根本听不进去，依然固执己见，双方为此争论得面红耳赤，朝堂上乱作一团。
陆真在宫中也察觉到了异样，最近御研坊的材料供应总是出问题，不是数量不够，就是质量不达标。她暗中调查后发现，原来是一些与娄太后余党有勾结的官员在背后搞鬼，他们试图通过断供材料，让御研坊无法正常运作，从而迫使陆真放弃科研。
面对这些阻碍，陆真没有退缩。她一方面亲自去拜访那些支持科研的大臣，向他们详细阐述科研的意义和前景，争取他们的支持；另一方面，她开始尝试寻找替代材料，降低对那些被控制材料的依赖。
在寻找替代材料的过程中，陆真偶然听说民间有一种特殊的矿石，据说这种矿石硬度极高，还具有一定的韧性，如果能运用到兵器制造中，肯定能大大提升兵器的性能。于是，她决定亲自去民间寻找这种矿石。
高湛得知陆真要出宫，十分担心她的安危，但他也知道陆真的脾气，一旦决定的事情就很难改变，只好安排了一队身手矫健的侍卫暗中保护她。
陆真带着玲珑和侍卫们乔装打扮成普通百姓，踏上了寻找矿石的路途。一路上，他们风餐露宿，西处打听矿石的下落。经过几天的奔波，终于在一个偏远的山村打听到了矿石的线索。村民们告诉他们，这种矿石就藏在村子后面的深山里，但山里地势复杂，还有凶猛的野兽出没，十分危险。
陆真没有被困难吓倒，她带领众人毅然走进了深山。在山中，他们遭遇了多次危险，有一次还差点被一条巨大的蟒蛇攻击，幸好侍卫们反应迅速，才化险为夷。
经过一番艰难的寻找，他们终于找到了那种特殊的矿石。陆真看着眼前的矿石，眼中闪烁着兴奋的光芒。她迫不及待地带着矿石回到御研坊，开始进行实验。经过多次的尝试和改进，她终于成功地将这种矿石运用到了兵器制造中，制造出的兵器比之前更加锋利、坚固。
陆真带着新兵器来到朝堂，向大臣们展示其威力。只见她轻轻一挥手中的剑，一块坚硬的石头瞬间被劈成两半，在场的大臣们都被这一幕惊呆了。那些原本反对科研的大臣，看到如此神奇的兵器，也不禁对陆真的科研成果刮目相看。
然而，正当局势逐渐好转时，娄太后余党又开始了新的阴谋。他们买通了宫中的一名太医，准备在高湛的药中下毒……
晨光斜斜照进司衣司，陆真整理着案头的绸缎，余光瞥见沈碧踉跄着撞开雕花木门。对方发髻歪斜，脸上还沾着泥点，往日精心描绘的柳叶眉此刻拧成一团，像只被惊飞的寒鸦。
"陆、陆姐姐..."沈碧嗓音发颤，指甲深深掐进掌心，连行礼都忘了，"昨夜...昨夜我在冷宫听见怪声，像是有人在念咒..."
陆真慢条斯理地将鎏金护甲套在指尖，金属碰撞发出清脆声响："沈姑娘不是最擅长装神弄鬼？怎么自己倒怕起这些了？"她抬眸，目光如淬了毒的银针，精准刺中沈碧眼底的恐惧，"莫不是做了太多亏心事，连鬼魂都看不下去？"
沈碧突然跪倒在地，裙摆扫落案上青瓷笔洗。"我真的什么都没做！"她扯着陆真的裙角，胭脂晕染的脸颊泛着青白，"求你救救我，我不想死..."
陆真嫌恶地甩开她的手，袖中纳米芯片在暗处微微发烫。看着沈碧狼狈逃窜的背影，她勾起唇角轻笑——这不过是纳米装置制造的神经干扰，若沈碧再敢轻举妄动，真正的惩罚才刚刚开始。
